Malgré son impopularité, il resta près de 6 ans à la tête des Bleus et hissa l'équipe en finale de la Coupe du monde 2006. Il fut à la tête de l'équipe pendant la grève de Knysna.
Il parvient à qualifier les Bleus pour l'Euro 2012. Sortie du premier tour, l'équipe de France est éliminée par l'Espagne, future vainqueur de la compétition, en 1/4 de finale.
Il qualifia les Bleus pour le Mondial 2014 suite à un barrage épique contre l'Ukraine. Emmène l'équipe en finale de l'Euro 2016 et remporte le titre mondial en 2018.